Enstitü, eski ve ortaçağ Türk yazılı eserlerinin araştırılmasını temel çalışma alanlarından biri olarak kabul etmektedir. Orhun-Yenisey yazıtları, Çağatayca eserler ve diğer eski Türk yazılı anıtlarının dili, içeriği, tarihî ve kültürel önemi bilimsel olarak incelenmektedir. Bu eserlerin metinsel özellikleri, dil yapıları ve tarihî kaynak değeri belirlenmekte, ayrıca bilim dünyasına kazandırılması için çalışmalar yapılmaktadır. Bunun yanında eski mirasın korunması, yayımlanması ve araştırma yöntemlerinin geliştirilmesine de önem verilmektedir.